Menurut JPN, barang hasil bongkaran kemudian dipindahkan ke gudang lain yang disewa GBS. Pemindahan itu menggunakan uang Bulog hingga mencapai Rp6,2 miliar untuk membayar sewa gudang. Selain itu, GBS menjual barang hasil bongkaran, senilai Rp500 juta.
JPN juga mendapati uang Bulog sebesar Rp23 miliar digunakan untuk membayar tagihan hutang GBS di Bank Bukopin. Malahan GBS menggunakan uang Bulog sebesar Rp32,5 miliar untuk membeli tanah. Setelah diakumulasikan dengan kerugian Bulog yang timbul akibat hilangnya keuntungan Bulog sebesar 12 persen setahun, JPN menilai perbuatan petinggi GBS dan Bulog itu telah merugikan negara secara materil hingga Rp244,2 miliar.